南通外向型农业综合开发区机构设置：
（一）办公室
（二）财审局
（三）经济发展局
（四）规划建设局
（五）综合行政执法局
（六）安全生产监督管理局
（七）农村工作局
（八）县自然资源和规划局外农分局
按照有关法律、法规和政策规定，设立区（街）人大工委、纪工委、工会、共青团、妇联、人民武装等组织。建立基层政协联络工作机制。
